תפילה לחבקוק הנביא על שגיונות. רש״י מציין שיש הפותרים את המילה כתרגומה, ולפי משמעה יש בה בקשה. מצודת דוד מבאר: תפילתו היתה בעבור ששגג והתרעם כלפי ה׳, ולכן חזר להתפלל לפניו. הפרק השלישי שונה לגמרי משני הראשונים: הוא אינו נבואה אלא תפילה, והוא כתוב בלשון שירה עם הוראות נגינה. הכותרת עצמה מודה בכך שהיו כאן דברים שנאמרו בשגגה, וזו הכרה נדירה של נביא בכך שהטחתו חרגה.
תפלה לחבקוק, תפלה זו נחלקת לשלשה חלקים, (חלק א' עד מהר פארן סלה פסוק ג') התפלל על זמן הגלות שלא יסתיר ה' פניו מעמו וסיים במלת סלה. (חלק ב' מן כסה שמים הודו, עד ערות יסוד עד צואר סלה פסוק י"ג) התפלל על הנהגת ה' בזמן הגלות ועל התגלות ה' בעת הגאולה עת יצא לישע את עמו וסיים במלת סלה. (חלק ג' מן פסוק י"ד עד סוף הסימן) התפלל על העת שיהיו ישראל למשסה ועל חבלי משיח והודיע שהחבוים והצרות יהיו סימן הגאולה: